Clase 282 Biotecnología molecular: Hibridación genomica comparativa o CGH

Laboratorio de Fisiología Molecular Y Estructural

5 Apr 202007:41

Summary

TLDRLa hibrización genómica comparativa (CGH) es una técnica de citogenética molecular utilizada para detectar variaciones en el número de copias de ADN entre dos muestras. Se emplea principalmente en el diagnóstico de cáncer y defectos de nacimiento debido a anormalidades cromosómicas. La CGH permite explorar los 26 cromosomas humanos y detectar microdeletiones y duplicaciones. Existe una variante, la CGH con microarreglos de ADN, que mejora la detección de anormalidades y permite mapear cambios en la secuencia genómica. Un estudio de 1000 casos demuestra la efectividad de la CGH como primera opción en el diagnóstico genético de desequilibrios genómicos.

Takeaways

🔬 La hibridación genómica comparativa (CGH) es una técnica de citogenética molecular utilizada para analizar variaciones en el número de copias de ADN en comparación con el genoma normal.
🌟 La CGH se originó principalmente para evaluar diferencias en el cromosoma en tumores sólidos y tejidos normales.
🔍 Se emplea la hibridación competitiva fluorescente in situ (FISH) para etiquetar el ADN de ambas muestras con colores diferentes y luego comparar las señales fluorescentes.
📊 Los resultados se interpretan según la intensidad de la señal fluorescente, indicando ganancia o pérdida de material en regiones específicas del cromosoma.
🧬 La CGH permite explorar los 26 cromosomas humanos en una sola prueba y detectar lesiones a nivel microscópico.
📈 Existe una variante de la técnica CGH que utiliza microarreglos de ADN, denominada aCGH, que permite una detección más detallada de diferencias y mapear cambios en la secuencia genómica.
🏥 La CGH ha demostrado ser una técnica específica, sensible, rápida y de alto rendimiento en el análisis de variaciones en el número de copias de ADN.
👨‍⚕️ La CGH es cada vez más requerida en el diagnóstico, identificando cambios cromosómicos recurrentes en diversas enfermedades, como el cáncer y defectos de nacimiento.
📊 Un estudio mencionado en el guion analiza la eficiencia de la CGH como primera línea de diagnóstico en 1000 pacientes con malformaciones congénitas y trastornos del espectro autista.
📈 En el estudio, se detectaron desequilibrios de efecto patogénico en un 14% de los pacientes, demostrando la efectividad y eficiencia de la CGH como test de diagnóstico genético.

Q & A

¿Qué es la hibridación genómica comparativa (CGH)?
-La hibridación genómica comparativa (CGH) es un método de citogenética molecular utilizado para analizar variaciones en el número de copias de ADN en dos muestras a comparar, principalmente para evaluar diferencias en el cromosoma de tejidos tumorales y normales.
¿Cómo se realiza la hibridación competitiva fluorescente in situ en la CGH?
-Implica el aislamiento del ADN de ambas muestras, su etiquetado con florescentes de colores diferentes, la desnaturalización del ADN para volverlo monocatenario y la hibridación de las muestras para observar la agrupación de cromosomas en la metafase.
¿Qué se interpreta con una mayor intensidad de color en la muestra de problema en la CGH?
-Una mayor intensidad de color en la muestra de problema indica una ganancia de material en una región específica del cromosoma.
¿Qué indica una mayor intensidad de color en la muestra control en la CGH?
-Una mayor intensidad de color en la muestra control sugiere una pérdida de material en la muestra de ensayo en una región específica.
¿Cuál es el significado de la visualización de un color neutro en la CGH?
-La visualización de un color neutro, generalmente amarillo, indica que no hay diferencia entre las dos muestras en la región analizada.
¿Cuántos cromosomas humanos pueden explorarse con la CGH?
-La CGH permite explorar 26 cromosomas humanos en una sola prueba.
¿Qué es la variante de la técnica CGH que utiliza microarreglos de ADN?
-Es la técnica de hibridación genómica comparativa con microarreglos (aCGH), que permite detectar diferencias en el número de copias cromosómicas y localizar desequilibrios genómicos con más detalle.
¿Cómo se marcan las muestras en la aCGH?
-La muestra de problema se marca generalmente con el fluoroforo rojo y la muestra de control con el ADN de referencia se marca con el fluoroforo verde.
¿Qué se ha demostrado sobre la efectividad de la CGH en el diagnóstico genético?
-La CGH ha demostrado ser una técnica específica, sensible, rápida y de alto rendimiento en comparación con otras técnicas para el análisis de variaciones del número de copias de ADN.
¿En qué porcentaje de pacientes se detectaron desequilibrios de efecto patogénico con la CGH en el estudio mencionado?
-En el estudio, se detectaron desequilibrios de efecto patogénico en un 14% de los 1000 pacientes afectados por patologías como malformaciones congénitas y trastornos del espectro autista.

Outlines

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🔬 Introducción a la Hibridación Genómica Comparativa (CGH)

El primer párrafo introduce la técnica de Hibridación Genómica Comparativa (CGH), un método de citogenética molecular que analiza variaciones en el número de copias de ADN en dos muestras. La CGH se utiliza principalmente para detectar diferencias en el material genético en tumores sólidos y tejidos normales. Se describe el proceso de hibridación competitiva fluorescente in situ, donde se etiqueta el ADN de ambas muestras con colores diferentes y se comparan las señales fluorescentes para determinar ganancias o pérdidas de material genético. La CGH permite examinar 26 cromosomas humanos y detectar anormalidades microscópicas. También se menciona la variante de esta técnica, conocida como Hibridación Genómica Comparativa con Microarreglos (aCGH), que permite una detección más detallada y la asignación de cambios directamente en la secuencia genómica.

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📊 Evaluación de la CGH en el diagnóstico genético

El segundo párrafo aborda un estudio que evaluó la eficiencia de la CGH como primera línea de diagnóstico en pacientes con malformaciones congénitas y trastornos del espectro autista. Se describe cómo los microarreglos de ADN se utilizan junto con la técnica de CGH para explorar la dosis de ADN en múltiples regiones genómicas. El estudio examinó a 1000 pacientes y detectó desequilibrios genómicos de efecto patogénico en el 14% de los casos. Los resultados sugieren que la CGH es una herramienta efectiva y eficiente en el diagnóstico genético, especialmente en la detección de desequilibrios genómicos en pacientes con síntomas sospechosos.

Mindmap

Keywords

💡Hibridación genómica comparativa (CGH)

La Hibridación genómica comparativa, o CGH, es un método de citogenética molecular que se utiliza para analizar variaciones en el número de copias de ADN en comparación con el genoma normal. En el video, se menciona que esta técnica se originó principalmente para evaluar diferencias en el cromosoma en tejidos tumorales sólidos y tejidos normales. La CGH permite la exploración de 26 cromosomas humanos en una sola prueba, lo que demuestra su capacidad para detectar anormalidades en el ADN.

💡Florescentes

En el contexto del video, los 'florescentes' se refieren a los marcadores que se utilizan en la técnica de hibridación genómica comparativa. Se etiquetan las muestras de ADN con florescentes de colores diferentes, generalmente rojo y verde, para luego comparar la intensidad de la señal fluorescente y determinar si hay ganancia o pérdida de material genético en una región específica del cromosoma.

💡Desnaturalización del ADN

La 'desnaturalización del ADN' es el proceso por el cual el ADN se vuelve monocatenario, es decir, se separan las dos cadenas helicoidales para poder realizar la hibridación. Este paso es crucial en la técnica de CGH, ya que permite que las muestras de ADN se unan a su secuencia complementaria en la metafase, facilitando la comparación de secuencias genómicas.

💡Microscopio de fluorescencia

El 'microscopio de fluorescencia' es el instrumento utilizado para observar y analizar las señales fluorescentes emitidas por las muestras de ADN marcadas. En el video, se menciona que este microscopio, junto con un software, ayuda a comparar las intensidades de las florescentes y a interpretar los resultados de la CGH.

💡Ganancia de material

La 'ganancia de material' en el video se refiere a una anomalía en la cual hay una mayor cantidad de ADN en una región específica del cromosoma en la muestra de prueba en comparación con la muestra de control. Esto se detecta a través de una mayor intensidad del color de la flor o foro en la región correspondiente, lo que indica una anormalidad en la cantidad de copias de ADN.

💡Pérdida de material

La 'pérdida de material' es el opuesto de la ganancia de material y se refiere a una disminución en la cantidad de ADN en una región específica del cromosoma en la muestra de prueba. Se identifica cuando la intensidad del color de la flor o foro en la muestra de control es mayor que en la muestra de prueba, lo que sugiere una anormalidad en la cantidad de copias de ADN.

💡Color neutro

El 'color neutro', generalmente amarillo cuando se utilizan florescentes rojo y verde, indica que no hay diferencia entre las dos muestras en una región específica del genoma. Esto se menciona en el video como un resultado ideal en la CGH, ya que sugiere que la región está representada de manera normal en ambos genomas comparados.

💡Micro arreglos de ADN

Los 'micro arreglos de ADN' son utilizados en una variante de la técnica de CGH conocida como aCGH. Estos arreglos son fragmentos de ADN que se fijan en un soporte y se utilizan para comparar las cantidades relativas de ADN de dos genomas. En el video, se explica que esta técnica permite una detección más detallada de diferencias en el número de copias cromosómicas y puede mapear cambios directamente sobre la secuencia genómica.

💡Desequilibrios genómicos

Los 'desequilibrios genómicos' son alteraciones en el número de copias de ADN en una región específica del genoma, que pueden ser causadas por ganancias o pérdidas de material genético. En el video, se menciona que la CGH es una herramienta útil para detectar estos desequilibrios, que son comunes en enfermedades como el cáncer y defectos de nacimiento.

💡Diagnóstico genético

El 'diagnóstico genético' se refiere al proceso de identificación de anomalías genéticas para determinar la causa subyacente de una condición médica. En el video, se destaca la efectividad de la CGH como una herramienta de diagnóstico genético, especialmente en pacientes con sospecha de desequilibrios genómicos, como retraso en el desarrollo, malformaciones congénitas y trastornos del espectro autista.

Highlights

La hibridación genómica comparativa (CGH) es un método de citogenética molecular utilizado para analizar variaciones en el número de copias de ADN.

La CGH se originó para evaluar diferencias en cromosomas en tejidos tumorales y normales.

La técnica implica la hibridación competitiva fluorescente in situ (FISH) para comparar dos muestras de ADN.

Las muestras de ADN se etiquetan con florescentes de colores diferentes, generalmente rojo y verde.

Desnaturalización del ADN y posterior hibridación de las muestras marcadas para observar agrupaciones en la metafase.

Se utilizan microscopios de fluorescencia y software para comparar las intensidades de las señales fluorescentes.

Una mayor intensidad de color en una muestra indica ganancia o pérdida de material genético en una región específica.

La visualización de color neutro indica que no hay diferencias entre las muestras en una región específica.

La CGH permite explorar los 26 cromosomas humanos en una sola prueba y detectar lesiones a nivel microscópico.

Existe una variante de la CGH que utiliza microarreglos de ADN, denominada aCGH.

La aCGH permite detectar diferencias en el número de copias cromosómicas y localizar desequilibrios genómicos.

La aCGH es más detallada y puede mapear cambios directamente sobre la secuencia genómica.

La CGH ha demostrado ser una técnica específica, sensible y de alto rendimiento en comparación con otras técnicas.

La CGH es cada vez más requerida en el diagnóstico y permite identificar nuevos cambios cromosómicos recurrentes.

La metodología de la CGH se basa en el principio de comparar el ADN de una muestra de referencia con el de una muestra de problema.

Los resultados de la CGH se interpretan según la proporción de colores, indicando duplicaciones o deleciones genéticas.

Un estudio evaluó la eficiencia de la CGH como primera línea de diagnóstico en 1000 pacientes con malformaciones congénitas y trastornos del espectro autista.

La CGH detectó desequilibrios de efecto patogénico en un 14% de los pacientes estudiados.

La CGH es una herramienta diagnóstica con alto rendimiento en pacientes con sospecha de desequilibrios genómicos.