Clase 282 Biotecnología molecular: Hibridación genomica comparativa o CGH
Summary
TLDRLa hibrización genómica comparativa (CGH) es una técnica de citogenética molecular utilizada para detectar variaciones en el número de copias de ADN entre dos muestras. Se emplea principalmente en el diagnóstico de cáncer y defectos de nacimiento debido a anormalidades cromosómicas. La CGH permite explorar los 26 cromosomas humanos y detectar microdeletiones y duplicaciones. Existe una variante, la CGH con microarreglos de ADN, que mejora la detección de anormalidades y permite mapear cambios en la secuencia genómica. Un estudio de 1000 casos demuestra la efectividad de la CGH como primera opción en el diagnóstico genético de desequilibrios genómicos.
Takeaways
- 🔬 La hibridación genómica comparativa (CGH) es una técnica de citogenética molecular utilizada para analizar variaciones en el número de copias de ADN en comparación con el genoma normal.
- 🌟 La CGH se originó principalmente para evaluar diferencias en el cromosoma en tumores sólidos y tejidos normales.
- 🔍 Se emplea la hibridación competitiva fluorescente in situ (FISH) para etiquetar el ADN de ambas muestras con colores diferentes y luego comparar las señales fluorescentes.
- 📊 Los resultados se interpretan según la intensidad de la señal fluorescente, indicando ganancia o pérdida de material en regiones específicas del cromosoma.
- 🧬 La CGH permite explorar los 26 cromosomas humanos en una sola prueba y detectar lesiones a nivel microscópico.
- 📈 Existe una variante de la técnica CGH que utiliza microarreglos de ADN, denominada aCGH, que permite una detección más detallada de diferencias y mapear cambios en la secuencia genómica.
- 🏥 La CGH ha demostrado ser una técnica específica, sensible, rápida y de alto rendimiento en el análisis de variaciones en el número de copias de ADN.
- 👨⚕️ La CGH es cada vez más requerida en el diagnóstico, identificando cambios cromosómicos recurrentes en diversas enfermedades, como el cáncer y defectos de nacimiento.
- 📊 Un estudio mencionado en el guion analiza la eficiencia de la CGH como primera línea de diagnóstico en 1000 pacientes con malformaciones congénitas y trastornos del espectro autista.
- 📈 En el estudio, se detectaron desequilibrios de efecto patogénico en un 14% de los pacientes, demostrando la efectividad y eficiencia de la CGH como test de diagnóstico genético.
Q & A
¿Qué es la hibridación genómica comparativa (CGH)?
-La hibridación genómica comparativa (CGH) es un método de citogenética molecular utilizado para analizar variaciones en el número de copias de ADN en dos muestras a comparar, principalmente para evaluar diferencias en el cromosoma de tejidos tumorales y normales.
¿Cómo se realiza la hibridación competitiva fluorescente in situ en la CGH?
-Implica el aislamiento del ADN de ambas muestras, su etiquetado con florescentes de colores diferentes, la desnaturalización del ADN para volverlo monocatenario y la hibridación de las muestras para observar la agrupación de cromosomas en la metafase.
¿Qué se interpreta con una mayor intensidad de color en la muestra de problema en la CGH?
-Una mayor intensidad de color en la muestra de problema indica una ganancia de material en una región específica del cromosoma.
¿Qué indica una mayor intensidad de color en la muestra control en la CGH?
-Una mayor intensidad de color en la muestra control sugiere una pérdida de material en la muestra de ensayo en una región específica.
¿Cuál es el significado de la visualización de un color neutro en la CGH?
-La visualización de un color neutro, generalmente amarillo, indica que no hay diferencia entre las dos muestras en la región analizada.
¿Cuántos cromosomas humanos pueden explorarse con la CGH?
-La CGH permite explorar 26 cromosomas humanos en una sola prueba.
¿Qué es la variante de la técnica CGH que utiliza microarreglos de ADN?
-Es la técnica de hibridación genómica comparativa con microarreglos (aCGH), que permite detectar diferencias en el número de copias cromosómicas y localizar desequilibrios genómicos con más detalle.
¿Cómo se marcan las muestras en la aCGH?
-La muestra de problema se marca generalmente con el fluoroforo rojo y la muestra de control con el ADN de referencia se marca con el fluoroforo verde.
¿Qué se ha demostrado sobre la efectividad de la CGH en el diagnóstico genético?
-La CGH ha demostrado ser una técnica específica, sensible, rápida y de alto rendimiento en comparación con otras técnicas para el análisis de variaciones del número de copias de ADN.
¿En qué porcentaje de pacientes se detectaron desequilibrios de efecto patogénico con la CGH en el estudio mencionado?
-En el estudio, se detectaron desequilibrios de efecto patogénico en un 14% de los 1000 pacientes afectados por patologías como malformaciones congénitas y trastornos del espectro autista.
Outlines
🔬 Introducción a la Hibridación Genómica Comparativa (CGH)
El primer párrafo introduce la técnica de Hibridación Genómica Comparativa (CGH), un método de citogenética molecular que analiza variaciones en el número de copias de ADN en dos muestras. La CGH se utiliza principalmente para detectar diferencias en el material genético en tumores sólidos y tejidos normales. Se describe el proceso de hibridación competitiva fluorescente in situ, donde se etiqueta el ADN de ambas muestras con colores diferentes y se comparan las señales fluorescentes para determinar ganancias o pérdidas de material genético. La CGH permite examinar 26 cromosomas humanos y detectar anormalidades microscópicas. También se menciona la variante de esta técnica, conocida como Hibridación Genómica Comparativa con Microarreglos (aCGH), que permite una detección más detallada y la asignación de cambios directamente en la secuencia genómica.
📊 Evaluación de la CGH en el diagnóstico genético
El segundo párrafo aborda un estudio que evaluó la eficiencia de la CGH como primera línea de diagnóstico en pacientes con malformaciones congénitas y trastornos del espectro autista. Se describe cómo los microarreglos de ADN se utilizan junto con la técnica de CGH para explorar la dosis de ADN en múltiples regiones genómicas. El estudio examinó a 1000 pacientes y detectó desequilibrios genómicos de efecto patogénico en el 14% de los casos. Los resultados sugieren que la CGH es una herramienta efectiva y eficiente en el diagnóstico genético, especialmente en la detección de desequilibrios genómicos en pacientes con síntomas sospechosos.
Mindmap
Keywords
💡Hibridación genómica comparativa (CGH)
💡Florescentes
💡Desnaturalización del ADN
💡Microscopio de fluorescencia
💡Ganancia de material
💡Pérdida de material
💡Color neutro
💡Micro arreglos de ADN
💡Desequilibrios genómicos
💡Diagnóstico genético
Highlights
La hibridación genómica comparativa (CGH) es un método de citogenética molecular utilizado para analizar variaciones en el número de copias de ADN.
La CGH se originó para evaluar diferencias en cromosomas en tejidos tumorales y normales.
La técnica implica la hibridación competitiva fluorescente in situ (FISH) para comparar dos muestras de ADN.
Las muestras de ADN se etiquetan con florescentes de colores diferentes, generalmente rojo y verde.
Desnaturalización del ADN y posterior hibridación de las muestras marcadas para observar agrupaciones en la metafase.
Se utilizan microscopios de fluorescencia y software para comparar las intensidades de las señales fluorescentes.
Una mayor intensidad de color en una muestra indica ganancia o pérdida de material genético en una región específica.
La visualización de color neutro indica que no hay diferencias entre las muestras en una región específica.
La CGH permite explorar los 26 cromosomas humanos en una sola prueba y detectar lesiones a nivel microscópico.
Existe una variante de la CGH que utiliza microarreglos de ADN, denominada aCGH.
La aCGH permite detectar diferencias en el número de copias cromosómicas y localizar desequilibrios genómicos.
La aCGH es más detallada y puede mapear cambios directamente sobre la secuencia genómica.
La CGH ha demostrado ser una técnica específica, sensible y de alto rendimiento en comparación con otras técnicas.
La CGH es cada vez más requerida en el diagnóstico y permite identificar nuevos cambios cromosómicos recurrentes.
La metodología de la CGH se basa en el principio de comparar el ADN de una muestra de referencia con el de una muestra de problema.
Los resultados de la CGH se interpretan según la proporción de colores, indicando duplicaciones o deleciones genéticas.
Un estudio evaluó la eficiencia de la CGH como primera línea de diagnóstico en 1000 pacientes con malformaciones congénitas y trastornos del espectro autista.
La CGH detectó desequilibrios de efecto patogénico en un 14% de los pacientes estudiados.
La CGH es una herramienta diagnóstica con alto rendimiento en pacientes con sospecha de desequilibrios genómicos.
Transcripts
la hibridación genómica comparativa o
cgh es un método de citogenética
molecular utilizado para analizar las
variaciones en el número de copias con
relación al nivel deploy día del adn en
dos muestras a comparar la play día es
el número de juegos completos de
cromosomas en una célula esta técnica se
originó principalmente para evaluar las
diferencias creamos ubicación tumor
sólido y un tejido normal la metodología
que utilizan se encuentra la hibridación
competitiva fluorescente in situ en esto
se implica el aislamiento del adn de la
de ambas muestras ambas se van a
etiquetar de manera independiente con
floro foros diferentes que generalmente
de un color rojo y verde para proceder a
la desnaturalización del adn para
volverlo mono catenaria y después a la
hibridación de las dos muestras esto
para ver una agrupación normal de los
cromosomas en la meta fase a las cuales
las muestras de adn marcada se van a
unir en su locución y gen
a continuación las señales fluorescentes
que se emitan se van a comparar con
ayuda de un microscopio de fluorescencia
y un software los resultados que se
emitan se van a interpretar dependiendo
de la intensidad del flor o foro por
ejemplo si hay una mayor intensidad en
el color que provenga de la muestra
problema en una región específica del
cromosoma éste va a indicar la ganancia
de material en dicha región por otro
lado si existe una mayor intensidad de
color en la muestra control y va a
indicar la pérdida de material en la
muestra de ensayo o en la muestra
problema en la región específica también
pueden existir
y la visualización de un color neutro
generalmente suele ser amarillo si se
utilizaron los flor o foros rojo y verde
esto va a indicar que no hay diferencia
entre las dos muestras en esta región la
cgh permite la exploración de 26
cromosomas humanos en una sola prueba y
la detección de lesiones y de
aplicaciones a nivel microscópico existe
una variante de esta de esta técnica
donde se utilizan micro arreglos de adn
en conjunto con la técnica de este gh se
le denominó a raíz de hibridación
genómica comparativa esta es una técnica
que permite la detección de diferencias
en el número de copias cromosómicas
entre dos ambos genomas y también se
puede localizar las regiones de los
desequilibrios genómicos del paciente
permite la detección de anormalidades
con más detalle y también es posible
mapear los cambios directamente sobre la
secuencia genómica
la cgh ha demostrado ser una técnica
específica sensible rápida y de alto
rendimiento en comparación con otras
técnicas que se utilizan para el
análisis de la variación del número de
copias de adn haciendo que su aplicación
sea cada vez más y más requerida en el
diagnóstico
este método permite identificar nuevos
cambios cromosómicos recurrentes como
micro de lesiones y duplicaciones en
condiciones o diversas enfermedades
humanas como lo es en cáncer y defectos
de nacimiento debido a las anormalidades
cromosómicas su metodología se basa en
el principio de la cgh convencional
ambas técnicas utilizan un adn de la
muestra de referencia o de control y el
adn del paciente o el adn problema se
van a marcar ambos con los floro foros
diferentes y se van a utilizar sondas
que se hibridan de forma competitiva a
objetivos de ácido nucleico
en el cgh convencional el objetivo es
una propagación de la meta fase de
referencia mientras que en el cgh estos
objetivos pueden ser fragmentados
genómicos clonados en una variedad de
vectores estos vectores puede ser
plásmidos
la muestra de problema o la muestra
ensayos se marca generalmente con el
foro foro rojo y la muestra de control
con el adn de referencia se va a marcar
con un floor o foro verde la misma
cantidad de ambas muestras de adn se van
a mezclar y se van a brindar con un
micro arreglo de adn es la diferencia
que tiene también con la convencional
como ya había mencionado la convencional
no utilice este micro arreglo la cgh si
lo utiliza bueno después de la
de la hibridación se van a utilizar
sistemas digitales para poder capturar y
cuantificar las intensidades de la
fluorescencia y que se van a emitir
dependiendo de los flor o foros los
resultados se van a interpretar como una
cgh convencional por ejemplo si la
intensidad de los forofos son iguales en
una sonda esta región el genoma del
paciente se va a interpretar como que
tienen la misma cantidad de adn en las
muestras de ensayo que en la referencia
o sea en la misma muestra el problema
que en la muestra control y en el caso
de que el adn contenga una duplicación
se va a observar mayor proporción del
color verde y si hay una de lesión habrá
una menor proporción es donde se
predominará el color rojo
hablaremos ahora acerca de un artículo
el cual lleva por nombre array cgh como
primera opción en el diagnóstico
genético mil casos y análisis de coste
beneficio
los arrays de hibridación genómica
comparada oa cgh son la herramienta
diagnóstica con mayor rendimiento en
pacientes con malformaciones congénitas
y trastornos del espectro autista el
objetivo del presente trabajo ha sido
evaluar la eficiencia del uso de la cgh
como primera línea de diagnóstico en
estas y otras indicaciones
los haces te permiten explorar de manera
simultánea la dosis de adn en múltiples
hilos y el genoma al comparar las
cantidades relativas de adn de dos
genomas control y paciente marcados con
flor o cromos distintos que se unen con
fragmentos de adn de secuencia conocida
o sondas que están fijadas a un
portaobjetos o un soporte vivir
el color de la fluorescencia en cada
punto de la cgh nos va a informar la
cantidad relativa de cada dn y permite
inferir la presencia de ganancias o de
pérdidas en regiones concretas del
genoma
se ha estudiado a 1000 pacientes
afectados por las patologías mencionadas
mediante la técnica de acg h y se
detectaron desequilibrios de efecto
patogénico en un 14% de los pacientes
según el fenotipo se diagnosticaron un
18.9 por ciento de pacientes afectados
con retraso global el desarrollo y
discapacidad intelectual un 13 por
ciento de malformaciones congénitas un 9
por ciento de las patologías
psiquiátricas y un 7 por ciento de casos
con epilepsia y un 13 por ciento con
pacientes con talla baja los resultados
nos demuestran la efectividad y
eficiencia de la utilización de la cgh
como un test en la primera línea en el
diagnóstico genético de pacientes con
sospecha de desequilibrios genómicos
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