Penjelasan singkat CRISPR CAS 9 (Bahasa Indonesia) #crisprcas9 #genomeediting
Summary
TLDRThis script delves into the world of CRISPR-Cas9, a revolutionary gene-editing tool. It explains the basic concept of CRISPR, the proteins involved, such as Cas9 and tracrRNA, and how they target and cut specific DNA sequences. The video also touches on the different types of Cas proteins and their functions, the role of guide RNA in identifying the target, and the application of CRISPR in gene editing, including non-homologous end joining and homology-directed repair. The script promises a more detailed explanation in subsequent sessions.
Takeaways
- π¬ CRISPR-Cas9 is a gene-editing technology that allows for precise targeting and editing of DNA sequences.
- π The acronym CRISPR stands for 'Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats', which is a pattern found in the DNA of certain bacteria.
- 𧬠The CRISPR-Cas9 system involves two main components: the Cas9 protein, which acts as a 'scissors' to cut DNA, and guide RNA (gRNA), which directs the Cas9 to the specific DNA sequence to be edited.
- π§¬πͺ There are different types of Cas proteins, such as Cas9, Cas12, and Cas13, each with unique capabilities and applications.
- π The gRNA in the CRISPR system is crucial as it recognizes and binds to a specific DNA sequence, enabling the Cas9 protein to cut the DNA at the desired location.
- π§¬π The CRISPR-Cas9 system can be used for various applications, including gene editing, gene regulation, and even creating gene drives.
- π¬π In gene editing, CRISPR-Cas9 can introduce changes such as deletions, insertions, or substitutions in the DNA sequence to study or modify traits.
- π§¬π The script discusses the importance of understanding the structure and function of the Cas9 protein, which has two main parts: the recognition lobe (for DNA targeting) and the nuclease lobe (for cutting the DNA).
- π§¬ππ The process of CRISPR-Cas9 involves the Cas9 protein and gRNA complex recognizing a specific DNA sequence, known as the PAM (protospacer adjacent motif) site, and cutting the DNA strands.
- π§¬πππ§ The script also touches on the potential for CRISPR-Cas9 to be used in gene drives, which are mechanisms that can spread a particular genetic trait through a population quickly.
Q & A
What is the main topic of the video script?
-The main topic of the video script is the explanation of CRISPR-Cas9, a gene-editing technology, including its components and how it works.
What does CRISPR stand for?
-CRISPR is an acronym for Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats.
What is the function of the Cas9 protein in the CRISPR-Cas9 system?
-The Cas9 protein acts as the 'scissors' in the CRISPR-Cas9 system, responsible for cutting the DNA at the targeted location.
What is the role of guide RNA (gRNA) in CRISPR-Cas9?
-The guide RNA (gRNA) directs the Cas9 protein to the correct location on the DNA strand to be cut, ensuring specificity in the gene-editing process.
What are the different types of Cas proteins mentioned in the script?
-The script mentions Cas9, Cas12, and Cas13 as different types of Cas proteins, each with specific functions and target preferences.
What is the significance of the PAM sequence in CRISPR-Cas9?
-The PAM (Protospacer Adjacent Motif) sequence is crucial for the recognition of the target DNA by the gRNA and Cas9 protein, ensuring that the correct DNA sequence is cut.
How does the CRISPR-Cas9 system distinguish between double-stranded and single-stranded DNA?
-Different Cas proteins have preferences for cutting either double-stranded or single-stranded DNA. For instance, Cas9 typically targets double-stranded DNA.
What are the two main repair mechanisms after DNA is cut by CRISPR-Cas9?
-The two main repair mechanisms after DNA is cut by CRISPR-Cas9 are non-homologous end joining (NHEJ) and homology-directed repair (HDR).
What is the difference between NHEJ and HDR?
-NHEJ is an error-prone repair mechanism that can result in mutations, while HDR is a more precise repair process that uses a donor DNA template to guide the repair.
How is the CRISPR-Cas9 system applied in gene editing?
-In gene editing, the CRISPR-Cas9 system is used to introduce specific changes to the DNA sequence by cutting the DNA at desired locations and allowing the cell's repair mechanisms to introduce the desired modifications.
What are some of the components needed for the CRISPR-Cas9 system to function?
-Some of the components needed for the CRISPR-Cas9 system include the Cas9 protein, guide RNA (gRNA), target DNA, and possibly a donor DNA template for HDR.
Outlines
𧬠Introduction to CRISPR-Cas Systems
The first paragraph introduces the CRISPR-Cas system, a revolutionary gene-editing tool discovered from the immune response of bacteria. It explains that CRISPR stands for 'Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats' and is associated with the Cas proteins, which are enzymes that perform the cutting of DNA. The paragraph outlines the basic components and functions of the CRISPR-Cas system, including the guide RNA (gRNA) that directs the Cas protein to the specific DNA sequence to be cut. It also mentions different types of Cas proteins, such as Cas9, Cas12, and Cas13, each with unique capabilities.
π Understanding CRISPR Components and Functions
The second paragraph delves deeper into the components of the CRISPR system, focusing on the guide RNA (gRNA) and the tracrRNA, which are essential for recognizing the target DNA sequence. It discusses the role of the Cas proteins, particularly Cas9, in the cutting process and how the system can be directed to target either double-stranded or single-stranded DNA. The paragraph also touches on the specificity of the CRISPR system, highlighting how it can be programmed to recognize and cut particular sequences, which is crucial for precise gene editing.
π οΈ CRISPR-Cas System Application in Gene Editing
The third paragraph discusses the application of the CRISPR-Cas system in gene editing, explaining the process from the initial binding of the Cas protein to the target DNA sequence to the actual cutting action. It outlines the two main types of gene editing outcomes: non-homologous end joining (NHEJ) and homology-directed repair (HDR). NHEJ is described as a process that can introduce mutations without a donor DNA template, while HDR is a more precise method that uses a donor DNA to repair the cut site, allowing for specific genetic changes. The paragraph concludes by mentioning the requirements for performing CRISPR gene editing, including the Cas protein, gRNA, tracrRNA, and the target DNA.
Mindmap
Keywords
π‘CRISPR
π‘Cas9
π‘Guide RNA (gRNA)
π‘DNA
π‘Gene Editing
π‘Palindromic
π‘Prokaryotic
π‘Target Sequence
π‘Double-Stranded DNA
π‘Homology-Directed Repair (HDR)
π‘Non-Homologous End Joining (NHEJ)
Highlights
Introduction to CRISPR-Cas9 system and its components
CRISPR is an adaptive immune system in prokaryotic cells
CRISPR-Cas9 can target specific DNA sequences for cutting
Cas9 protein is the 'scissors' that cuts the DNA
Guide RNA (gRNA) directs Cas9 to the target DNA sequence
Different Cas proteins have different cutting capabilities
Cas9 can cut double-stranded DNA, while Cas12a and Cas13 can cut single-stranded RNA
CRISPR-Cas9 system involves specific terms like CRISPR RNA (crRNA), trans-activating crRNA (tracrRNA), and Cas9 protein
tracrRNA helps in stabilizing the RNA-DNA complex for Cas9 to cut
Different Cas9 variants have different PAM (protospacer adjacent motif) requirements
Explaining the structure and function of Cas9 protein
Cas9 has recognition lobe (R-loop) for target identification and nuclease lobe for cutting
Guide RNA (gRNA) is composed of crRNA and tracrRNA that bind to target DNA and recruit Cas9
Cas9's nuclease activity is activated upon target recognition
Different gRNA designs can lead to different editing outcomes
Application of CRISPR-Cas9 in genome editing - non-homologous end joining (NHEJ) and homology-directed repair (HDR)
NHEJ relies on mutation and can introduce indels, while HDR requires a donor DNA template
Components needed for CRISPR-Cas9 genome editing: Cas9 protein, gRNA, and target DNA
Transcripts
hai oke Kembali lagi bersama saya hari
ini saya akan menjelaskan apa itu
Christopher Smith nah ini crisper kesini
lagi hangat isunya baik untuk siram
editing atau pun juga untuk gue serius
saya mau memperkenalkan
Apa itu Kris parkes Styles dan bagaimana
sistem cara kerjanya ya dalam bahasa
Indonesia
Oke kita lihat dulu is for questions
jadi
secara umum Khair singkatan dari Cluster
regularly and transports palindromic
tipis intinya adalah Christopher ini
adalah siklus yang ditemukan peneliti di
orbit semur prokariotik yang mana dengan
siklus ini bisa mentargetkan suatu
meskipun spesifik yang mana henti ini
bisa dilakukan pemotongan a
pemotongannya ini menggunakan protein
namanya Kya jadi cast nya adalah dan er
crisper asosiasi asosiatif protein jadi
kesini adalah enzim nyari Nah jadi
krispera ini adalah skuadnya denkes ini
adalah alat pemotong nanti kita lihat
apa saja yang terlibat dalam sistem
crisper cast
Kris percaya sini
nah pertama-tama jadi kita lihat dulu ya
jadi dalam sistem kristal queensland ini
ada istilah-istilah tertentu yang perlu
kita pahami ya yang pertama itu ada
namanya GF Erna dan juga casting Casting
Ikan sudah kita ketahui ada adalah
protein alat pemotongnya jenis pada
dasar e-cash e-cash
ini sendiri ada banyak keluarganya ada
quesnay ada cash 12 amalnya haddaqah 13
dan 14
masing-masing eh jenis kesini punya
kelebihannya masing-masing Hai ada yang
bisa potong double strand Lidya DNA ada
juga yang single sini ada juga bisa
potong arena secara khusus kita akan
bahas yang questnya jadi kasta ini
targetnya adalah
double Helix ya Dek double-stranded DNA
oke nah bagaimana sixnine ini bisa
mengenali target nanti
ada ml Na jadi get arena ini nanti bisa
memandu skesta ini
mengenali target lalu yang potong it
yang potong targetnya adalah sixlight
jadi gak Garena ini adalah yang
mengarahkan dan STN ini adalah
eksekutornya ibaratnya nah pertama-tama
Biasanya kalau dalam
[Tepuk tangan]
eksperimen
cash nine krishn ini biasanya Eh ini
harus didimax pertama kali ya
pertama-tama siapkan nanti ketika mereka
mix nanti
kalau targetnya
juga ada di di dalam satu campurkan itu
nanti baru bisa bereaksi ya
oke nah komponennya apa aja kita lihat
dulu ya komponennya adalah yang pertama
itu Eh quesland proteinnya ini adalah
protein enzim ini ini yang saya katakan
tadi yang yang motong target dan juga
gaib er namanya tauzia ranah lagi
veterna sendiri ini banyak
istilah-istilah tertentu di
literatur-literatur baik jurnal ataupun
buku-buku yang
mana itu ada istilahnya CR Erna tahu
crispy Erna dan trek Erna transaktif
aktor Chris farren dan juga dah SJ arena
sirine single Cut Irna jadi single
garena1 Garena ya oke ah ah ah kita
lihat dulu secara detail Apa itu cash
nonprotein Negeri kesenian protein ini
adalah protein yang ukurannya itu 160 kg
ya ukurannya ini 160 kg tonne cukup
cukup besar yaitu hanya
dan
fungsi utamanya adalah untuk memotong
DNA target ingat yang eksekutornya
adalah cast lainnya yang membimbing
Sykes TNI mengenali target adalah si
gaya arenanya ya Nah HKSN protein
sendiri Ini ada dua bagian ada namanya
RC atau
recognition lob ya Dari dari
kepanjangannya kita ketahui recognition
ini untuk mengenali gitu dan ada yang UC
yaitu nukleus look nukleusnya berarti
adalah yang memotong jadi getaran itu
nempel di bagian er c-nya ya nanti
setelah di recognize targetnya Itu
dipotong di bagian ini nutch
Oke ada juga ini
kita lain langsung lanjut saja ya ini ke
glitter Nah setelah kita tahu ada itu
Kris kesmen petugas kita lanjut ke krna
zrn
ini
terdiri dari kristal Erna than
Three karena fungsinya apa bedanya apa
ya
Christopher Erna ini untuk mengenali
target
jadi misalnya ini targetnya sore ini
misal adalah satu double-stranded DNA
atau double Helix DNA tahu ya yang dua
rantainya nah misal targetnya ini ini
yang menjadi target nanti ini akan di
kenali di Serena
oke nah Three karena fungsinya apa jadi
Three karena ini nanti yang membimbing
si
as-syaikh rrna ke
queensland protein Jadi sebelum Rain iya
Hai jadi fungsinya terakhir karena ini
adalah untuk mengenali bahwa Uni six
nonprotein
[Musik]
jadi akan di dalam satu larutan tuh di
dalam satu eppendorf biasanya diem
Situbondo ketika
masuk kita memasukkan questline
proteinnya Eh bagaimana caranya sih si a
secret arena ini bisa mengenali atau
bisa mix dengan atau bisa bandingin
dengan tak bisa membuat si questnya
mengenali target ya adalah dengan Three
karena ini ya jadi fungsinya Three
karena untuk mengambil membantu cc
KYT rrx ini
bertemu dengan kesen protein nanti
ketika sudah ketemu Nah baru nanti
sixteenth proteinnya bisa aktif mengenai
targetnya eh dan ada satu lagi istilah
namanya adalah Fame yang nanti akan kita
lihat PM ini adalah foto
spesial aja sih motif
Si Kevin protein akan
mengenali targetnya di dari Ini adanya
fansite ya Nah untuk selain sendiri
fansite yaitu biasanya ini
ngangguk2 saya setiap argued yang n
disini bisa berupa
art-tech atau atau sihir nah
ah jadi setiap target setiap siklus yang
punya misal ratakan AGG akhir-akhir
anti-ship kesen proteinnya akan
mengunjungi sikon sebut yang ada giginya
lalu
akan terjadi
apa and winding lalu Ice kira-kira ini
targetnya bukan ya Nah mengeceknya
Bagaimana ini tergantung enggak nah ini
tadi ada bagian dari jerena namanya
adalah trek Rena ini tadi yang mengenali
langsung itu ada Solid Kris pernah
mengenal langsung namanya jelas syiar
arena oke
oke Ini adalah PMR dan masing-masing PM
ini
masing-masing Kespro TNI punya tainya
sendiri misal yang
yang ke-14 ya Ada PMS sendiri dan
lain-lainnya jadi untuk excellent in
sendiri pm-nya Ini adalah ng
lalu dimana proses detail ya proses kita
lihat eh jadi Saya membagi dua sebelum
DNA dipotong dan sesudah DNA dipotong
oke nah pertama-tama sih
Nah ini tadi yang diawal tadi ya yang si
kesen protein yang sudah
bergabung dengan jaga Tere nakhre akan
mengenali
fansite naiknya Jadi mereka akan
menemukan fansite Nah makanya dalam satu
desain eksperimen
bagaimana
pertama-tama Harus ditentukan dulu
websitenya di ada di mana ya Nah ketika
sudah tahu m saatnya baru
target apa yang ingin yang ingin
dipotongnya itu yang yang yang yang
harus ditentukan ya Nah biasanya
seketika sudah ketemu targa apa fansite
nanti sih Iya si quesland proteinnya
Khan ada tanknya kesikuan dan langsung
ah
menemukan targetnya ya ada kado satu
kasus tmptnya ada tapi tidak ada target
si konser itu dia tidak akan bisa
memotong
Oke Nah setelah dia masuk website Nadia
akan Ajib dulu nih deh nanya kira-kira
Ada nggak targetnya ya kalau tidak ada
dia lanjut lagi menemukan pmc yang lain
ya Nah kalau ternyata ada targetnya maka
dia akan langsung potong Oke ingat jadi
ya tahapannya pertama
sigret ernap itu akan bergabung dengan
SM protein dan mereka akan menemukan PM
saatnya ketika PM saatnya ketemu lalu
mereka selanjutnya akan mencari
targetnya kalau tidak terakhir tidak ada
target mereka akan ganti lagi cari
fansite yang lain sampai ketemu ntar
targetnya Nah kalau sudah ketemu
targetnya maka akan dipotong ya
nah bagaimana diaplikasi di the di jino
editing nah ini saya akan Jelaskan yang
aktor Kaltim prosesnya ya jadi ketika
setelah dipotong ini ada dua pilihan
ada namanya non homologous enjoy ini
motion dan ada juga yang homologi
directed prepare nah bedanya apa bedanya
adalah homologi rectifier ini kita
apa bahwa donor dna-nya dan masukkan ke
bagian yang dipotong itu tadi
hai eh jadi setelah dipotong Kan itu ada
ini ya potongannya nanti intinya dalam
HDR ini Um lobby derek tipe ini
DNA ingin kita masukkan itu
harus akan di bawah ya namanya donor DNA
sementara yang bagian lain itu proses
lain namanya adalah nhj atau nonformal
bisa nentuin jadi ini mengandalkan
mutasi jadi dibiarkan begitu saja tanpa
ada donor DNA eh tanpa ada donor DNA
jadi dia akan mengalami mutasi bisa itu
delesi inversi ataupun mutasi mutasi
lainnya mungkin Secara detailnya akan
saya jelaskan di sisi lainnya nanti ya
bagaimana cara Chino editing secara
detail Oke secara samri jadi untuk
melakukan untuk crisper queensland
health system ini apa saja yang
dibutuhkan yang pertama itu cast main
protein hai eh lalu Jia Jia Ren angkat
ernanto bis berupa syiar arena dan Three
karena dan juga bisa buffer dan juga DNA
target
kemungkinan itu saja yang bisa saya
bagikan ya mungkin nanti di Sesi
selanjutnya lebih detail akan saya
jelaskan Lagi Sama
5.0 / 5 (0 votes)