ELECTROFORESIS de ADN en GEL de AGAROSA [TEÓRICO y PRÁCTICO]

Nutrimente
28 Jun 202112:19

Summary

TLDREl vídeo explica la técnica de electroforesis, utilizada para separar moléculas como ADN, ARN o proteínas según su tamaño y carga eléctrica en un campo eléctrico. Se enfoca en la electroforesis en gel de agarosa, donde las moléculas de ADN se separan según su longitud en pares de bases. Se detalla el proceso de preparación del gel, la incorporación de bromuro de tibio, la carga de muestras y marcadores de peso molecular, y la corrida del gel. Finalmente, se visualizan las bandas de ADN en un transiluminador UV, permitiendo determinar su tamaño y comprobar la eficacia de técnicas como la PCR.

Takeaways

  • 🔬 Electroforesis es una técnica utilizada para separar moléculas en base a su tamaño y carga eléctrica en un campo eléctrico.
  • 🧬 Los científicos aplican electroforesis para separar ADN, ARN y proteínas en el laboratorio.
  • 📊 La electroforesis en gel de agarosa es una forma específica de esta técnica que permite la separación de moléculas a través de una matriz porosa.
  • ⚡️ Los ácidos nucleicos, debido a su estructura con grupos fosfato, tienen una carga negativa y migran hacia el ánodo en la electroforesis.
  • 🔑 La velocidad de migración de las moléculas en el gel se ve influenciada por la fuerza eléctrica y la fuerza de rozamiento.
  • 🌐 La fuerza de rozamiento es directamente proporcional al tamaño y forma de la molécula, y a las características del medio como la viscosidad.
  • 🧪 El ADN de doble cadena en una solución acuosa no se separa eficientemente debido a la baja fricción, lo que requiere el uso de un medio soporte como el gel.
  • 🌀 Los gels de agarosa y poliacrilamida son comunes en laboratorios para proporcionar una red molecular que aumenta la fricción y reduce la difusión.
  • 📏 La elección del porcentaje de agarosa en el gel afecta el tamaño del poro y, por ende, la separación de fragmentos de ADN de diferentes longitudes.
  • 🔎 Los marcadores de peso molecular son esenciales para determinar el tamaño de los fragmentos de ADN durante la electroforesis, permitiendo comparar y estimar longitudes.

Q & A

  • ¿Qué es la electroforesis y para qué se utiliza?

    -La electroforesis es una técnica que sirve para la separación de moléculas según su movilidad en un campo eléctrico. Se utiliza en el laboratorio para separar moléculas de ADN, ARN o proteínas en base a su tamaño y carga eléctrica.

  • ¿En qué dirección migran los ácidos nucleicos durante la electroforesis?

    -Los ácidos nucleicos, debido a su carga negativa, migran hacia el polo positivo, es decir, hacia el ánodo.

  • ¿Qué fuerzas afectan la velocidad de las partículas en la electroforesis?

    -Las partículas en la electroforesis están sujetas a dos fuerzas de acción opuestas: la fuerza eléctrica que atrae a la partícula hacia el electrodo y la fuerza de rozamiento que se opone a su migración.

  • ¿Cómo se relaciona la carga y el tamaño de una molécula con su migración en el gel durante la electroforesis?

    -Cuanta más carga y menor masa tenga la molécula, más rápido migrará a través del gel. Por otro lado, más pequeña y flexible sea la molécula, más rápido emigrará.

  • ¿Qué es un gel de agarosa y cómo se utiliza en la electroforesis?

    -Un gel de agarosa es una matriz porosa utilizada en la electroforesis para separar macromoléculas. Aumenta la fricción recibida por las macromoléculas y reduce la difusión, permitiendo una separación eficiente.

  • ¿Cómo se prepara una solución de agarosa para el gel de electroforesis?

    -Se mezcla agarosa con buffer de corrida y se calienta en microondas hasta que la agarosa se disuelva. Se agrega bromuro de tibio para visualizar el ADN más tarde.

  • ¿Qué es un marcador de peso molecular y cómo se utiliza en la electroforesis?

    -Un marcador de peso molecular es una mezcla de fragmentos de ADN de tamaño conocido que se utiliza para comparar las muestras en la corrida y determinar el tamaño de los fragmentos de ADN en las muestras.

  • ¿Cuál es el propósito de agregar bromuro de tibio al gel de agarosa?

    -El bromuro de tibio es un intercalante del ADN que permite visualizar las moléculas de ADN una vez que el gel es expuesto a luz ultravioleta, ya que se torna fluorescente.

  • ¿Cómo se determinan los tamaños de los fragmentos de ADN en una electroforesis en gel de agarosa?

    -Se compara la distancia migrada por los fragmentos de ADN con la del marcador de peso molecular en paralelo, lo que permite estimar el tamaño de los fragmentos en la muestra incógnita.

  • ¿En qué áreas tiene aplicación la electroforesis en gel de agarosa?

    -La electroforesis en gel de agarosa tiene múltiples aplicaciones en la medicina, genética, biotecnología, ingeniería genética y en el ámbito forense y en el reconocimiento de personas.

Outlines

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🔬 Introducción a la Electroforesis

El primer párrafo introduce la técnica de la electroforesis, que es utilizada para separar moléculas en un campo eléctrico según su tamaño y carga eléctrica. Se explica que los científicos la emplean para separar ADN, ARN o proteínas. Se menciona que en el vídeo se verá la electroforesis en gel de agarosa, un método que permite observar la migración de moléculas hacia el polo positivo (ánodo) en una matriz porosa. Se destaca que la velocidad de migración de las moléculas está influenciada tanto por la fuerza eléctrica como por la fuerza de rozamiento, dependiendo de su tamaño y forma. Además, se menciona que los ácidos nucleicos, debido a su estructura, tienen una carga negativa y migran hacia el ánodo. Se describe cómo la electroforesis se utiliza para separar macromoléculas en laboratorio, y cómo el tamaño y la forma de las moléculas afectan su migración a través del gel.

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🧪 Preparación y Ejecución de la Electroforesis en Gel de Agarosa

El segundo párrafo detalla el proceso de preparación y ejecución de la electroforesis en gel de agarosa. Se describe cómo se prepara el gel, incluyendo la elección del porcentaje de agarosa para regular el tamaño del poro y la adición de bromuro de tibio como intercalante para visualizar el ADN. Se explica que el porcentaje de agarosa en el gel afecta la velocidad de migración de los fragmentos y cómo se puede observar la diferencia en los fragmentos más pequeños. Seguidamente, se describe el proceso de sembrar las muestras en el gel, incluyendo la preparación de las muestras con buffer de siembra y la carga de estas en el gel. También se menciona la utilización de un marcador de peso molecular para comparar y determinar el tamaño de los fragmentos de ADN. Finalmente, se describe cómo se realiza la electroforesis, conectando la fuente de la cuba y corriendo el gel hasta que el colorante del buffer de siembra haya migrado lo suficiente.

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📸 Análisis y Aplicaciones de la Electroforesis

El tercer párrafo se centra en el análisis y las aplicaciones de la electroforesis. Se describe cómo, una vez finalizada la electroforesis, el gel se expone a luz ultravioleta para visualizar los fragmentos de ADN mediante el bromuro de tibio fluorescente. Se menciona que la fotografía de la electroforesis muestra fragmentos separados según su longitud, permitiendo la identificación de una banda correspondiente al fragmento de interés. Además, se destaca la utilidad de la electroforesis en áreas como la medicina, la genética, la biotecnología, la ingeniería genética y el ámbito forense. Finalmente, se hace un llamado a la audiencia para que si les resultó útil el contenido, den like y se suscriban al canal para recibir más información.

Mindmap

Keywords

💡Electroforesis

Electroforesis es una técnica utilizada para separar moléculas en base a su tamaño y carga eléctrica mediante la aplicación de un campo eléctrico. En el vídeo, se explica que los científicos la emplean para separar moléculas de ADN, ARN o proteínas. Este concepto es fundamental para entender el proceso de separación de macromoléculas en el laboratorio.

💡ADN y ARN

Los ácidos nucleicos, ADN (Ácido Desoxirribonucleico) y ARN (Ácido Ribonucleico), son moléculas esenciales para la vida que almacenan y transmiten la información genética. En el vídeo, se menciona que, a diferencia de las proteínas, los ácidos nucleicos tienen una carga negativa debido a sus grupos fosfato, lo que influye en su migración durante la electroforesis.

💡Gel de agarosa

El gel de agarosa es un medio poroso utilizado en la electroforesis para separar moléculas de ADN. El vídeo destaca que este gel, debido a su consistencia gelatinosa, permite que las moléculas migren a través de él, separándose según su tamaño. La elección del porcentaje de agarosa en el gel determina el tamaño del poro y, por ende, la resolución de la separación.

💡Fuerza eléctrica y fuerza de rozamiento

Las fuerzas eléctrica y de rozamiento son dos fuerzas opuestas que afectan la migración de las moléculas en la electroforesis. El vídeo explica que la fuerza eléctrica atrae a las moléculas al electrodo opuesto, mientras que la fuerza de rozamiento se opone a su movimiento. La relación entre estas fuerzas determina la velocidad de migración de las moléculas a través del gel.

💡Carga y masa

La carga y la masa de una molécula son factores clave en la electroforesis, ya que determinan la aceleración que se impone a la molécula por la fuerza eléctrica. El vídeo señala que moléculas con más carga y menor masa migran más rápido a través del gel, lo que es crucial para la separación eficiente de macromoléculas.

💡Marcador de peso molecular

Un marcador de peso molecular es una mezcla de fragmentos de ADN de tamaños conocidos que se utiliza para comparar y determinar el tamaño de las moléculas en una muestra. En el vídeo, se menciona que se siembran en paralelo con las muestras para permitir la estimación del tamaño de los fragmentos de ADN en la electroforesis.

💡Buffer de siembra

El buffer de siembra es una solución que se mezcla con las muestras antes de sembrarlas en el gel de agarosa. Su función, como se describe en el vídeo, es dar densidad a las muestras para que caigan al fondo de los pocillos y también actúa como un colorante para facilitar la visualización del frente de migración durante la electroforesis.

💡Transiluminador UV

Un transiluminador UV es un equipo que emite luz ultravioleta y se utiliza para visualizar las bandas de ADN en el gel de agarosa después de la electroforesis. El vídeo menciona que la exposición al UV hace que el bromuro de tibio, que se había agregado al gel, se ilumine, permitiendo ver la posición de los fragmentos de ADN.

💡PCR

La PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa) es una técnica que se utiliza para amplificar segmentos específicos de ADN. El vídeo sugiere que, tras una PCR, se realiza una electroforesis en gel de agarosa para verificar la presencia y el tamaño del fragmento de interés, lo cual es un paso crucial en la validación de la amplificación genética.

💡Bromuro de tibio

El bromuro de tibio es un intercalante de ADN que se utiliza en la electroforesis para visualizar las bandas de ADN en el gel. El vídeo destaca que, aunque es un potente carcinógeno y debe manejarse con precaución, permite la visualización de las moléculas de ADN una vez que el gel ha sido expuesto a luz ultravioleta.

Highlights

Electroforesis es una técnica utilizada para separar moléculas según su movilidad en un campo eléctrico.

Los científicos usan electroforesis para separar moléculas de ADN, ARN o proteínas en función de su tamaño y carga eléctrica.

La electroforesis en gel de agarosa se utiliza para observar la migración de moléculas a través de una matriz porosa.

Los ácidos nucleicos, debido a su esqueleto de grupos fosfato, tienen una carga negativa y migran hacia el polo positivo (ánodo).

La velocidad de migración de una molécula en la electroforesis está influenciada por la fuerza eléctrica y la fuerza de rozamiento.

Moléculas con más carga y menor masa migran más rápido en la electroforesis.

Moléculas más pequeñas y flexibles pueden pasar más rápidamente entre los poros del gel.

La electroforesis se utiliza para separar macromoléculas en forma analítica o preparativas.

Los ácidos nucleicos tienen un fosfato cargado negativamente por cada nucleótido, y su relación carga-masa es independiente de la secuencia y tamaño de la molécula.

La separación de moléculas de ADN de doble cadena en una electroforesis depende de su tamaño y longitud en pares de bases.

Para una separación eficiente de moléculas en electroforesis, se utiliza un medio soporte como un gel que aumenta la fricción y reduce la difusión.

Los gels de polímero orgánico como la agarosa o la poliacrilamida son usados en laboratorios para su consistencia gelatinosa y estabilidad.

La preparación del gel de agarosa incluye el regulado del porcentaje de agarosa para controlar el tamaño del poro y la velocidad de migración de las moléculas.

El bromuro de tibio se agrega al gel para visualizar las moléculas de ADN durante la electroforesis.

Las muestras se mezclan con un buffer de siembra para darles densidad y facilitar su carga en el gel durante la electroforesis.

Los marcadores de peso molecular son utilizados para comparar y determinar el tamaño de los fragmentos de ADN en la electroforesis.

La electroforesis se realiza conectando la fuente de la cuba y corriendo el gel hasta que el colorante del buffer de siembra haya migrado lo suficiente.

El transiluminador UV permite visualizar la posición de los fragmentos de ADN en el gel después de la electroforesis.

La electroforesis tiene múltiples aplicaciones en la medicina, genética, biotecnología, ingeniería genética y en el ámbito forense.

Transcripts

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electroforesis es una técnica que sirve

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para la separación de moléculas según la

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movilidad de estas en un campo eléctrico

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los científicos la usan en el

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laboratorio para separar moléculas de

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adn arn o proteínas en base a su tamaño

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y carga eléctrica

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en el vídeo de hoy vamos a ver la

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electroforesis en gel de agarosa

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bienvenidos a una nueva edición de nutri

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mente

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a diferencia de las proteínas las cuales

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pueden tener una carga neta positiva o

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negativa los ácidos nucleicos están

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cargados de forma negativa debido a su

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esqueleto de grupos fosfato por lo tanto

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en una electroforesis los ácidos

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nucleicos migran hacia el polo positivo

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es decir hacia el ánodo

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al desplazarse a través de una matriz

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porosa como por ejemplo un gel de

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agarosa las moléculas de adn son

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sometidas a dos fuerzas de acción

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opuestas que determinan la velocidad de

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la partícula en cuestión por un lado la

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fuerza eléctrica que le atrae al

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electrodo cuya intensidad es

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directamente proporcional a la carga y

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de acuerdo a la segunda ley de newton

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les impone una aceleración directamente

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proporcional al cociente carga masa por

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otro lado la fuerza de rozamiento que se

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opone a la emigración con una intensidad

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que depende del tamaño y la forma de la

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partícula y de las características del

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medio por ejemplo la viscosidad y la

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estructura

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pasando en limpio cuanta más carga y

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menor masa tenga la molécula más rápido

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va a migrar a través del gel y cuanto

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más pequeña sea la molécula y tenga una

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forma más flexible o capaz de pasar

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entre los poros del gel más rápido

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emigrará por el contrario cuanta menos

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carga tenga y más grande sea más le

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costará pasar por entre los poros del

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gel y migrar a más lentamente la

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electroforesis se utiliza en el

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laboratorio para separar macromoléculas

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en solución en forma analítica es decir

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sólo para verlas o preparativas para

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purificar las

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los ácidos nucleicos tienen un fosfato

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cargado negativamente por cada

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nucleótido como el peso molecular de los

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cuatro nucleótidos es similar

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la relación carga masa es independiente

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de la secuencia y el tamaño de la

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molécula por lo tanto la aceleración

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impuesta por la fuerza eléctrica es

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igual para cualquier molécula de ácido

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nucleico la única diferencia en

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velocidad de migración estará dada por

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diferencias en la fuerza de rozamiento o

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sea de su forma y de su tamaño en el

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caso del adn de doble cadena suponiendo

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por ejemplo que todas las moléculas son

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fragmentos lineales la forma es la misma

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para cualquier molécula entonces las

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distintas moléculas tendrán una

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velocidad que solo dependerá de su

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tamaño es decir de su longitud en pares

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de bases

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sin embargo si tratáramos de separar

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moléculas de adn de doble cadena en una

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electroforesis en una solución acuosa

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nos encontraríamos con que el rozamiento

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impuesto por ésta es tan pequeño que

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todas las moléculas migrarían juntas

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además durante el electroforesis las

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moléculas se separarían unas de otras

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por difusión impidiendo el análisis para

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lograr una separación eficiente se

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utiliza un medio soporte que aumente

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considerablemente la fricción recibida

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por las macromoléculas y reduzca la

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difusión a un mínimo este medio suele

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ser una red molecular de algún polímero

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orgánico conocida como gel por su

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consistencia gelatinosa los más

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utilizados en el laboratorio de biología

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molecular son de pollo acrilamida una

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red molecular estabilizada por uniones

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covalentes y agarosa un derivado del

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agar agar un polisacárido extraído de un

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alga que al disolverlo forma una red

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estabilizada por interacciones no

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covalentes

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las mezclas de adn es de distinto tamaño

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se hace en migrar o correr en la jerga

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de laboratorio a través del gel durante

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un cierto tiempo y se obtiene una

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separación en la que la distancia

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emigrada por una molécula dada es

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inversamente proporcional a su longitud

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en pares de bases el tamaño de una

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muestra incógnita puede estimarse

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corriendo en paralelo muestras de

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longitud conocida cuando se hace un

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análisis selector poético de muestras de

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ácidos nucleicos que no poseen todas la

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misma forma debido por ejemplo a la

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presencia de estructuras secundarias que

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dependen del apareamiento interno o sea

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de la secuencia ya sea a rn o adn simple

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cadena es necesario para determinar su

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peso molecular homogeneizar su

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estructura para ello se utilizan agentes

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desnaturalizan test fuertes que

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destruyen la estructura secundaria

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habiendo visto la teoría ahora vamos al

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laboratorio virtual a ver la parte

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práctica supongamos que partimos de unas

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muestras de adn que obtuvimos luego de

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la amplificación tras una pcr como la

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que vimos en el vídeo anterior de esta

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serie después de la pcr necesitamos ver

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si efectivamente el gen de interés

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estaba en la muestra de adn templado y

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corroborar que el tamaño del fragmento

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amplificado coincida con lo buscado para

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esto vamos a hacer una electroforesis en

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gel de agarosa

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primero tenemos que preparar la solución

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de agarosa para hacer el gel regulando

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el porcentaje de agarosa en el gel se

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puede regular el tamaño del poro a mayor

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porcentaje de agarosa obtenemos un poro

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más chico en este caso todos los

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fragmentos migran más lentamente pero

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podremos observar diferencias de pocas

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bases en los fragmentos más chicos con

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geles de poliamida de poro aún más chico

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que la agarosa pueden verse diferencias

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e incluso de una base

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por otro lado a menor porcentaje de

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agarosa obtenemos un poro más grande y

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todos los fragmentos chicos correrán más

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rápidamente pero podremos resolver

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fragmentos de más alto peso molecular

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en este caso vamos a hacer un gel 2% más

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en volumen para esto vamos a pensar en

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una balanza un gramo de agarosa que es

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un polvo y lo vamos a poner en un vaso

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de precipitado con 50 mililitros de

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buffer de corrida que puede ser buffer

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tve o tae 1 x para saber más sobre

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soluciones y concentraciones puedes ver

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el vídeo correspondiente de esta serie

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vamos a incubar la solución en el

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microondas para fundir la garza en el

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buffer cuando la solución se encuentre

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fundida se agrega una muy pequeña

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cantidad de bromuro de tibio que es un

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intercalan té del adn es decir una

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molécula que se introduce entre las

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hebras de adn y nos va a permitir

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visualizar las más adelante el pro muro

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decidió es un potente carcinógeno por lo

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que hay que realizar este paso con

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cuidado usando guantes

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cuando la solución se encuentra lista se

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vuelca en el molde que debe tener un

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peine colocado que va a formar los

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pocillos en donde vamos a sembrar las

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muestras

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se espera que solidifique y luego se

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retira cuidadosamente el peine y se

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quitan los topes de los bordes ya que

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éstos deben estar en contacto con el

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vaso

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se coloca el gel en la cuba de

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electroforesis y se agrega suficiente

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barrera de corrida para cubrir todo el

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gel

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teniendo el listón gel ahora tenemos que

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preparar las muestras se mezclan por

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ejemplo 5 microlitros de muestra con un

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micro litro de buffer de siembra 6 por

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cargando y descargando con la pipeta

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esto se puede hacer en un tubo de pendón

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o sobre un papel aluminio formando una

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gota y los volúmenes pueden variar de

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acuerdo al objetivo de la corrida y la

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concentración del buffer de siembra

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recordemos que estamos viendo solo un

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ejemplo ilustrativo

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la función del buffer de siembra es

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darle densidad de las muestras para que

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caigan al fondo de los pocillos y

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generalmente es coloreado para poder ver

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dónde está el frente de corrida mientras

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se corre el gel una vez lista la muestra

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se carga la pipeta con la misma y se

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apoya con delicadeza en uno de los

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bordes de un pocillo del gel calle en la

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jerga o web en inglés se descarga

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lentamente la muestra hasta el primer

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tope de la pipeta evitando la formación

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de burbujas

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además de las muestras en cada una de

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las calles del gel se siembra un

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marcador de peso molecular que es una

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mezcla comercial de fragmentos de adn de

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tamaño conocido que nos va a permitir

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comparar nuestras muestras en la corrida

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y determinar el tamaño de los fragmentos

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de adn en las mismas

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una vez que está el marcador de peso

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molecular y todas las muestras sembradas

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en cada uno de los pocillos del gel se

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conecta la fuente de la cuba con cuidado

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de que el polo positivo esté en el lado

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opuesto al sitio de siembra y se corre a

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voltaje constante cuando se aplica un

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campo eléctrico entre los extremos de la

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cuba los fragmentos del adn de carga

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negativa se desplazan hacia el polo

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positivo y se separan de acuerdo a su

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tamaño aplicamos el campo eléctrico

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hasta que el colorante del buffer de

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siembra haya migrado lo suficiente ya

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que es nuestro indicador visual para

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saber cómo están corriendo las muestras

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se apaga la fuente y se coloca el gel

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sobre un trans iluminador ub vimos este

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equipo en el vídeo de instrumentos de

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laboratorio parte 2 de esta serie

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la exposición del gel a la luz

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ultravioleta hace que el bromuro decidió

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que habíamos agregado cuando preparamos

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el gel y que está ahora unido al adn se

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torna el fluorescente lo cual hace

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visible la posición de los fragmentos en

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el gen

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la fotografía de una electroforesis en

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gel muestra fragmentos de adn separados

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según sus diferentes longitudes o

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números de pares de bases si la muestra

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era el resultado de una pcr observaremos

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una banda del tamaño correspondiente al

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fragmento que amplificamos con esa

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técnica para conocer el tamaño del

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fragmento se compara con el marcador de

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peso molecular que corremos en una de

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las calles del gel y en este ejemplo

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sería un fragmento de 400 pares de bases

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estos fragmentos pueden suficientemente

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ser extraídos intactos del gel para

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utilizarlos en un procedimiento

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posterior o simplemente se observan para

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obtener conclusiones

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cabe aclarar que existen múltiples

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variantes en la realización de esta

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técnica y que aquí vivimos en la parte

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práctica un ejemplo de cómo se lleva a

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cabo como veremos en otros vídeos esto

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tiene múltiples aplicaciones en el área

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de la medicina la genética la

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biotecnología la ingeniería genética y

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en el ámbito forense y en el

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reconocimiento de las personas

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si este vídeo te sirvió para aprender o

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comprender mejor este tema o si

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simplemente te gustó por favor dale like

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it' e invitó a suscribirte al canal para

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poder tener a mano mucha más información

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porque lo que sabes influencia tu

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destino

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